Shopify運用代行の選び方｜保守・更新・広告運用の業務範囲と料金の決まり方

「Shopifyでストアは作ったけれど、商品登録やバナーの差し替えに追われて広告まで手が回らない」「構築を頼んだ制作会社の保守契約が終わり、アプリの不具合を相談できる相手がいない」。ストアを公開した後は、こうした運営の悩みが出てきやすくなります。運用代行を探しても、保守だけを扱う会社、広告運用が中心の会社、運営をまるごと引き受ける会社が混在していて、比べ方が分かりにくいのも実情です。

この記事では、Shopify運用代行に任せられる業務を5つの領域に分け、Shopifyの保守で実際に必要な作業、どこまで任せるかを決める手順、料金の決まり方、契約前に確認したい7項目、管理画面の権限の渡し方までを整理します。

Shopify運用代行とは？

Shopify運用代行とは、公開後のShopifyストアの保守・更新・集客・顧客対応などの運営業務を、外部の会社が自社に代わって行うサービスです。ストアを作る「構築」が終わった後の、毎日・毎月続く業務を任せる点が特徴です。

依頼先の呼び方は、運用代行、運営代行、保守サービス、EC支援などさまざまです。名前よりも、どの業務を、どの頻度で、どこまでの品質で引き受けるのかで中身を判断します。

保守と運用の違いは？

保守は「ストアを正しく動く状態に保つ」作業で、運用は「ストアで売上を伸ばす」作業です。保守にはテーマの更新、アプリの入れ替え、表示崩れや不具合の対応が入り、運用には商品登録、キャンペーンの準備、広告運用、メール配信、数値の分析と改善が入ります。

売上を伸ばすための改善提案や実作業が保守契約に含まれるかは、契約内容によって異なります。反対に、広告運用が中心の会社は、テーマのコード修正を引き受けないことがあります。自社が困っているのがどちらなのかを先に整理すると、依頼先を絞り込みやすくなります。

制作会社への依頼とは何が違う？

制作会社への依頼は、デザインと構築を一定の期間で納品してもらう「プロジェクト型」が中心です。運用代行は、公開後の業務を月単位で続けて引き受ける「継続型」です。制作会社が公開後の保守まで引き受けることもありますが、集客や分析まで含むかどうかは会社によって異なります。

これからストアを作る段階で、構築の依頼先を探している場合は、Shopify制作会社の選び方で依頼先のタイプと見積もりの見方を解説しています。

運用代行に任せられる業務は？

Shopify運用代行に任せられる業務は、この記事では「保守・技術対応」「サイト更新」「受注・顧客対応」「集客」「CRM・分析」の5つに分けて整理します。1社で全部を引き受ける会社もあれば、1〜2領域に絞っている会社もあります。

受注・顧客対応は、商品知識や対応方針を踏まえ、自社に残すかを検討します。反対に、広告運用やテーマの保守は専門知識が必要で、社内で担当者を育てるより外に任せた方が早く回ることがあります。

集客を任せる場合は、広告アカウントとShopifyの連携が正しく設定されているかが成果の前提になります。連携の設定手順はShopify広告連携ガイドで確認できます。

依頼先の3タイプと向いているケース

運用代行の依頼先は、得意な領域で見ると、おおむね次の3タイプに整理できます。自社が一番困っている領域を得意とするタイプから候補を探すと、比べる相手を絞れます。

Shopifyの保守では何をする？

Shopifyの保守で必要になるのは、主にテーマの更新、アプリの整理、不具合への対応、管理画面の権限の管理です。Shopifyは事業者が自前でサーバーを用意・運用する必要がないサービスのため、自社サーバーで動かすECサイトとは保守の中身が変わります。

Shopify側が担う部分と事業者の責任

サーバーの管理や、ストアに追加したドメインのTLS証明書（SSL証明書とも呼ばれる）の発行は、Shopify側で行われます（出典：Shopifyヘルプセンター「SSL」）。そのため、サーバーの更新や証明書の更新作業を保守会社に頼む必要は基本的にありません。

ただし、決済やセキュリティの仕組みがShopify側にあっても、特定商取引法の表記や個人情報の扱いはストアを運営する事業者の責任です。法令対応の確認ポイントはShopifyセキュリティと法令対応ガイドにまとめています。

自社か運用代行が担う部分

• テーマの更新 ── Shopifyヘルプセンターによると、テーマの更新には、管理画面から更新版を下書きテーマに追加する方法と、Shopifyがバグやセキュリティ上の問題を修正する自動更新があります。手動で更新する際は、カスタマイズやアプリとの互換性、コード変更の引き継ぎを確認してから公開します。テーマストア以外で入手したテーマの更新は、テーマの制作者に確認します（出典：Shopifyヘルプセンター「テーマの更新」）。カスタマイズしたストアほど、更新前のバックアップと表示確認の手間が増えます。
• アプリの整理 ── アプリの中には、アンインストールしてもテーマに追加したコードが自動では消えないものがあります（出典：Shopify Help Center「Uninstalling apps」、英語）。使っていないアプリと残ったコードを定期的に見直すと、表示の遅れや不具合の原因を減らせます。
• 不具合の調査と修正 ── 表示崩れ、カートや決済画面の動作、アプリ同士の競合などを調べ、テーマかアプリか設定のどこに原因があるかを切り分けます。
• 権限の管理 ── 社員や外部の会社に渡した管理画面のアクセス権を、作業に必要な範囲に保ち、作業が終わった相手のアクセスを外します。

どこまで任せるかを決める4ステップ

任せる範囲は、今の業務を書き出し、時間がかかっている作業と専門知識が要る作業から順に外へ出すと決めやすくなります。最初から全部を任せるより、1〜2領域から始めて成果を見ながら広げる方が、費用と品質の見通しを立てやすくなります。

STEP 1　今の運営業務と担当者を書き出す

5つの領域ごとに、誰が・月に何時間・どの作業をしているかを一覧にします。担当者が決まっていない作業や、特定の1人しかできない作業のうち、手順書づくりや社内の分担の見直しでも回らないものが、外に任せる候補です。

STEP 2　自社に残す業務を決める

商品企画、価格の決定、お客様からのクレーム対応の最終判断など、自社の強みや責任に直結する業務は残します。運用代行には「決められたことを実行する作業」と「改善の提案」を任せ、最終判断は自社が持つ形にすると、方向性がぶれにくくなります。外に任せた後も、商品写真や説明文などの素材の用意、施策の承認、月次の振り返りへの参加は自社の役割として残ります。

STEP 3　成果を測る指標を決める

保守なら「不具合の連絡から対応までの日数」、サイト更新なら「依頼から反映までの日数」、集客なら「広告費に対する売上」や「新規購入の数」のように、領域ごとに見る数字を決めます。指標がないまま契約すると、作業量は分かっても成果を判断できません。

STEP 4　小さく始めて範囲を広げる

最初に任せる領域は決まった順番ではなく、不具合による売上停止リスク、作業負担、集客上の課題を比べて優先順位を決めます。最初の契約期間は効果を判断しやすい領域から任せ、月次の報告で作業内容と数字を確認します。連絡のしやすさや提案の質が分かった段階で、ほかの領域へ範囲を広げるかを判断します。

Shopifyに限らず、EC運営のどの業務を外に出すかの考え方は、EC運営の外注完全ガイドでも整理しています。

運用代行の料金は何で決まる？

Shopify運用代行の料金は、任せる領域の数、作業の量と頻度、対応のスピード、広告費の規模によって決まります。同じ「運用代行」でも中身が違うため、月額の金額だけで比べると判断を誤りやすくなります。

料金の決まり方は、主に次の4つの型に分かれます。1社の中で、保守は月額固定、広告運用は広告費に連動、のように組み合わせることもあります。

見積もりを比べるときは、各社に同じ業務一覧（STEP 1で作ったもの）を渡し、領域ごとの金額と含まれる作業を出してもらいます。運用代行の費用とは別に、Shopifyの月額料金や有料アプリの費用、広告費そのものがかかる点も確認しておきます。

契約前に確認したい7項目

運用代行の契約前には、作業範囲、対応のスピード、報告、権限、解約時の扱いを書面で確かめます。次の7項目を各社に同じ形で質問すると、比べやすくなります。

1. 作業範囲 ── 5つの領域のうち何が含まれ、何が別料金か。月の回数や時間の上限はあるか。
2. 対応のスピード ── 連絡を受け付ける時間帯、通常の依頼と不具合の連絡それぞれの対応日数。営業時間外に決済やカートが動かなくなったときの連絡先。
3. 連絡の方法と担当者 ── メール・チャットなどの連絡手段と、担当者が固定か、窓口が1つにまとまっているか。
4. 報告の内容と頻度 ── 月次レポートで作業内容と数字のどちらを、どの粒度で報告するか。改善提案は含まれるか。
5. 権限とアカウントの持ち主 ── Shopifyのオーナー権限、広告アカウント、計測ツールのアカウントを自社名義で持てるか。
6. テーマやアプリを触るときのルール ── 公開中のテーマを直接編集せず、複製したテーマで確認してから公開するか。バックアップの取り方。
7. 契約期間と解約時の引き継ぎ ── 最低契約期間、解約の予告期間、解約時に作業記録や設定内容を渡してもらえるか。

特に5番目は重要です。広告アカウントを運用会社の名義で作ると、解約したときに過去のデータや学習の結果を引き継げないことがあります。アカウントは自社で作り、運用会社には必要な権限だけを付ける形にしておきます。

依頼を始めるときの権限の渡し方と引き継ぎ

Shopifyの管理画面は、ログイン情報を共有せず、Shopifyパートナーである運用会社に「コラボレーターアカウント」でアクセスしてもらう方法が基本です。オーナー権限は自社に残したまま、作業に必要な範囲だけを渡せます。

コラボレーターアカウントで渡すときのポイント

• 4桁のアクセスコード ── 管理画面の設定にある4桁のコードを運用会社に伝え、運用会社がパートナー側の画面からアクセスを申請し、自社が承認します。コードは作り直すと古いものが使えなくなります。
• 必要な権限だけを付ける ── 承認するときに、商品の編集はできるが支払い情報は見られない、といった形で権限を絞れます。
• 二段階認証と自動失効 ── コラボレーターは二段階認証を有効にしないとログインできず、90日間そのストアにログインしていない場合、アクセスが自動で失効します。
• 契約終了時に削除する ── 作業が終わったらアクセスを削除し、広告アカウントやアプリなど、ほかに付与した権限もあわせて見直します。

（出典：Shopifyヘルプセンター「コラボレーターアカウント」）

引き継ぎで渡しておきたい情報

運用会社が最初の1か月で迷わないよう、使っているテーマとカスタマイズした箇所、導入済みのアプリとその目的、外部システム（在庫・物流・会計）との連携、広告と計測のアカウント一覧、よくある問い合わせと返信の方針をまとめて渡します。前の制作会社や保守会社から引き継ぐ場合は、コードを編集した箇所の記録をもらっておくと、テーマ更新のときの確認が速くなります。

Shopifyの構築・集客・CRMに関するほかの記事は、Shopifyとは｜EC構築の始め方と運用ガイドからテーマ別にご覧いただけます。

よくある質問

Q. Shopifyの運用代行は、どの業務から頼むのがよいですか？

A. Shopifyの運用代行をどの業務から頼むかは、決まった順番ではなく、ストアの課題に応じて決めます。不具合による売上停止リスク、作業負担、集客上の課題を比べて優先順位を決め、効果を判断しやすい領域から小さく始めると、予算が限られていても効果を確かめながら範囲を決められます。

Q. Shopifyの運用代行の費用は何で決まりますか？

A. Shopifyの運用代行の費用は、任せる業務領域の数、作業の量と頻度、対応のスピード、広告費の規模で決まります。料金の型には月額固定、作業量・時間制、広告費連動、成果報酬があり、同じ業務一覧を各社に渡して領域ごとの金額と含まれる作業を比べると判断しやすくなります。

Q. Shopifyの運用代行を頼むと、管理画面のログイン情報を渡す必要がありますか？

A. Shopifyの運用代行では、Shopify管理画面のログイン情報（IDとパスワード）を共有する必要はありません。Shopifyパートナーである運用会社にはコラボレーターアカウントでアクセスしてもらい、ストアのオーナー権限は自社に残したまま、作業に必要な権限だけを付けます。契約が終わったら、コラボレーターのアクセスを削除します。

Q. ストアを構築した制作会社以外に、Shopifyの運用代行を頼めますか？

A. ストアを構築した制作会社以外にも、Shopifyの運用代行は頼めます。引き継ぎでは、テーマのカスタマイズ箇所、導入済みのアプリ、外部システムとの連携、広告と計測のアカウント一覧を新しい運用会社に渡します。コードを編集した箇所の記録を前の制作会社からもらっておくと、テーマ更新の確認が速くなります。

Q. Shopifyの運用代行は、広告運用だけでも頼めますか？

A. Shopifyの運用代行は、広告運用だけのように1つの領域に絞って頼むこともできます。広告運用だけを任せる場合でも、広告アカウントとShopifyの連携や計測の設定が正しいかを最初に確認してもらい、広告アカウントは自社名義で持つようにします。

Shopifyの運用をまとめて相談するなら

Shopify運用代行を選ぶときに大切なのは、任せたい業務の領域を先に決め、料金の決まり方と成果の報告方法をそろえて比べることです。管理画面や広告アカウントの持ち主を自社に残しておけば、依頼先を変えるときも運営が止まるリスクを下げられます。

株式会社funnelは支援社数500社の実績があり、Shopifyでは公開後の保守から、Google・Meta広告の運用、Amazonとの連携まで、ご要望に応じて一貫して支援しています。月額保守サポート（月15,000円・税別）では、運用に関するお問い合わせ対応（月10回程度まで）、テキスト・画像の軽微な修正、技術相談に対応します。テーマ更新・アプリ整理などの対応可否と費用は、ストアの構成や作業内容を確認のうえ、個別にご案内します。広告運用など保守の範囲を超える業務は、任せたい内容を伺ったうえで個別にご提案します。これからストアを作る場合のShopify構築は初期費用30万円（税別）からで、標準プランには商品登録点数などの条件があります。詳細はShopify構築サービスのページでご確認いただけます。

こんな方におすすめです：

• 商品登録やページ更新に追われ、広告や分析まで手が回っていない
• 構築を頼んだ会社との保守契約が終わり、不具合を相談できる相手がいない
• 保守と広告運用を別々の会社に頼んでいて、連絡や管理が負担になっている
• どの業務を外に任せればよいか、自社だけでは判断しにくい

ご相談は無料です。ストアのURLと、今いちばん困っている業務をお知らせいただければ、今の運営体制を伺ったうえで、任せる業務と自社に残す業務を整理し、進め方をご提案します。保守だけ、広告運用だけのご相談にも対応します。お問い合わせフォームからお気軽にご連絡ください。

※本記事の情報は2026年11月時点のものです。最終更新：2026年11月7日

出典・参考資料

• Shopifyヘルプセンター「SSL」
• Shopifyヘルプセンター「テーマの更新」
• Shopify Help Center「Uninstalling apps」（英語）
• Shopifyヘルプセンター「コラボレーターアカウント」